Jak każdy lek, lek ten może powodować działania niepożądane, chociaż nie u każdego one wystąpią.
Bardzo rzadko (rzadziej niż u 1 na 10 000 osób)
U pacjentów ze znacznie uszkodzoną przednią, przezroczystą warstwą oka (rogówką) obserwowano mętne plamy na rogówce spowodowane przez odkładanie się wapnia w trakcie leczenia.
Częstość nieznana (częstość nie może być określona na podstawie dostępnych danych)
Łzawienie, zaczerwienienie oka, ból, uczucie pieczenia, światłowstręt. Zaburzenia widzenia mogą utrzymywać się przez kilka minut po zakropleniu.
Podczas długotrwałego stosowania leku może wystąpić owrzodzenie rogówki (grzybicze lub spowodowane przez oporne na gentamycynę szczepy bakterii).
Długotrwałe stosowanie, w przypadku nadwrażliwości, może prowadzić do reakcji alergicznej, plamicy małopłytkowej (objawiającej się skłonnością do siniaków i krwawień), omamów.